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分析肿瘤 RNA 可能有助于将患者与最有效的癌症治疗相匹配

来源:互联网 作者:羽昕 人气:0 发布时间:2021-09-24 17:52:33
NCI 的科学家们精心设计了一种分析肿瘤的新方法,他们认为这种方法有可能为更多患者带来精准的癌症医学。新方法基于分析患者肿瘤中的基因表达。基因表达是通过检查RNA(DNA的分子表亲)的水平来测量的。

分析肿瘤 RNA 可能有助于将患者与最有效的癌症治疗相匹配

NCI 的科学家们精心设计了一种分析肿瘤的新方法,他们认为这种方法有可能为更多患者带来精准的癌症医学。新方法基于分析患者肿瘤中的基因表达。基因表达是通过检查RNA(DNA的分子表亲)的水平来测量的。

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(当一个基因被表达时,它的 DNA 在一个称为转录的过程中被复制到 mRNA 中。然后使用 mRNA 通过称为翻译的过程制造蛋白质。)

 

相比之下,目前临床使用的大多数精准医学方法都是基于对数百个基因中 DNA 改变(例如突变)的分析。

 

“[基于 DNA] 的方法取得了一些重大胜利,”研究调查员、NCI病理学实验室主任、医学博士 Kenneth Aldape 说。但是“虽然值得追求,但那些成功却寥寥无几。”

 

该研究的负责人、医学博士、医学博士 Eytan Ruppin 表示,尽管基于 RNA 的基因表达测试具有改善精准医疗的潜力,但将基因表达数据转化为有助于治疗患者的信息一直具有挑战性。 NCI 的癌症数据科学实验室。

 

“令人兴奋的是,这是我们第一次想出一种方法来系统地做到这一点,然后对其进行全面测试,”鲁平博士补充道。

 

NCI 研究人员表明,他们的方法可以准确预测患者是否对以前的治疗有反应退出免责声明配合靶向治疗或免疫治疗。通过重新分析最近根据基因表达信息将患者与治疗相匹配的临床试验的数据,研究人员估计,与该研究中达到的水平相比,他们的方法可以将更多的患者与有益治疗相匹配。

 

但是,为了更多地了解其潜在用途,新方法仍需要在尚未接受治疗并及时跟进的患者中进行仔细测试,博士。 Ruppin 和 Aldape 都指出。

 

NCI 研究人员现在正准备逐步将新方法纳入 NIH 临床中心的患者护理中。这些努力将补充已经存在的基于 DNA 的方法。

 

研究结果于2020年 2 月 17 日在 bioRxiv 上共享,这是一个免费的在线档案,科学家可以在其中立即将他们的发现提供给科学界。档案中的文章没有经过同行评审,这意味着它们没有经过专家的质量和准确性评估。一份更详细的研究报告已提交同行评审和出版。

 

预测对靶向治疗的反应

人类基因组中有 20,000 到 25,000 个基因,它们之间有着复杂的关系。对于癌细胞,基因之间的一些关系有助于细胞存活,而另一些则是有害的。

 

这些关系会影响药物对人的癌症的影响。例如,一种针对“基因 A”突变形式的疗法可能只对肿瘤“基因 B”低表达的患者有效。

 

了解这样的相互作用可以帮助医生为个别患者选择最佳治疗方法。但识别这种相互作用是一个巨大的挑战,因为人类基因组中有 5 亿个可能的基因对组合,数量惊人,鲁平博士解释说。

 

在过去的几年里,他和他的同事们开发了计算工具,使用基因表达信息来推断基因对之间的关系,重点关注被靶向疗法或免疫疗法击中的基因。在这项新研究中,他们使用这些工具来分析包含来自数百名患者的分子数据的公开可用数据集,并在整个基因组中搜索相互作用。

 

“由于 NCI 发起、资助或领导的项目,主要是癌症基因组图谱,我们正在做的所有工作最近才得以实现,”鲁平博士说。

 

使用来自不同靶向治疗的 21 项临床试验的数据,他们的方法准确预测了 21 个数据集中的 17 个患者对治疗的反应。这些数据集涵盖了几种不同类型的癌症和十多种不同类型的靶向治疗。

 

他们使用类似的方法来预测接受免疫检查点抑制剂治疗的患者的反应。在 10 个数据集中的 7 个中,他们的方法准确预测了患者是否对免疫检查点抑制剂有反应。

 

虽然他们的方法并不总是准确,“有一个明确的信号表明它可能对患者有用,”鲁平博士说。他指出,通过进一步的测试,该团队希望他们能够了解更多信息并改进该方法。

 

新方法与 WINTHER 试验的比较

接下来,研究人员将他们的方法与最近对癌症患者进行的精准医学试验中使用的方法进行了比较,这些患者在接受标准疗法治疗后病情恶化。

 

在这项名为 WINTHER 的试验中,临床医生根据患者肿瘤中的 DNA 改变或 RNA 水平将患者与治疗相匹配。基于 RNA 的方法仅用于没有任何可与治疗相匹配的肿瘤 DNA 改变的患者。

 

Aldape 博士说,作为第一个使用 RNA 数据影响癌症治疗决策的临床试验,WINTHER 研究是一项重大进展。

 

WINTHER 研究人员使用的 RNA 方法是基于患者肿瘤中基因或试验中使用的每种药物靶向基因的表达。在根据这种 RNA 方法接受治疗的 86 名参与者中,23 人 (27%) 对治疗有反应。

 

但是,如果治疗选择以 NCI 团队的方法为指导,有多少患者会受益?

 

NCI 研究人员使用他们的方法来确定 FDA 批准的 32 种靶向癌症疗法中的哪一种最适合每位患者。他们估计,如果按照他们的方法选择治疗,74 名患者(86%)会做出反应。

 

然而,考虑到潜在的假阳性测试结果,更现实的估计将在 60% 左右,Ruppin 博士说。

 

在 NIH 临床中心测试该方法

该团队的方法正在慢慢地在 NIH 临床中心进行的癌症临床试验中使用。 NCI 领导者正在谨慎考虑如何最好地将这种方法融入临床中心的患者护理中。

 

Ruppin 博士和他的同事还与 NCI 的其他临床医生合作,计划对新方法进行随机临床试验。 Aldape 博士解释说,该试验将有助于解决有关该方法是否可靠并使患者受益的问题。

 

他说,目标是“逐渐地、仔细地了解我们方法的潜在好处。”

 

 

TAGS标签: 肿瘤 , 基因 , 癌症
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