首页 预防 资讯 抗癌 百科 癌症 保健 视频 养生 两性

致因

旗下栏目: 预防 资讯 抗癌 百科 癌症 保健 视频 养生 两性

新方法使用更少的组织来分析肿瘤蛋白质和基因

来源:互联网 作者: 人气:0 发布时间:2021-09-24 18:57:31
分析肿瘤的基因变化可以提供重要的信息,例如患者是否适合进行特定的靶向治疗,并且是治疗越来越多的癌症的一个重要方面。但肿瘤生物学家越来越了解整合 DNA 变化之外的多层信息以了解肿瘤如何运作的价值,包括关于肿瘤细胞中蛋白质的更详细信息。

新方法使用更少的组织来分析肿瘤蛋白质和基因

分析肿瘤的基因变化可以提供重要的信息,例如患者是否适合进行特定的靶向治疗,并且是治疗越来越多的癌症的一个重要方面。但肿瘤生物学家越来越了解整合 DNA 变化之外的多层信息以了解肿瘤如何运作的价值,包括关于肿瘤细胞中蛋白质的更详细信息。

image.png

(核心针活检的插图。研究人员已经开发出一种方法,可以使用来自单芯针活检的组织来分析肿瘤的蛋白质谱及其遗传变化。)

现在,研究人员已经开发出一种使用更少量组织进行联合分子分析的方法退出免责声明比以前可能。使用这种“微尺度”方法,研究人员能够找出为什么一些患有乳腺癌的女性对靶向治疗反应良好,而另一些则没有。

 

研究作者认为,这种方法可能是将肿瘤中的蛋白质分析(称为蛋白质组学)引入癌症治疗的一步。到目前为止,蛋白质组学分析需要太多的组织才能立即用于临床,但在这项研究中,在单芯针活检中获得的组织数量 足以分析肿瘤的蛋白质谱及其遗传变化。

 

通过从 14 名HER2 阳性 乳腺癌女性开始治疗前后收集的核心针活检,来自贝勒医学院和博德研究所的一个研究小组能够解释为什么其中 5 名女性对 HER2 靶向治疗没有反应。治疗,而其他 9 人做到了。

 

NCI 支持的研究结果于2020年 1 月 27 日发表在Nature Communications 上。

 

“这是一种非常有趣的方法,”斯坦福大学医学中心专门研究乳腺癌的肿瘤学家 George Sledge 医学博士评论道。他预计这种方法会引起更广泛的乳腺癌社区的兴趣,特别是如果它在多个医疗中心的更多患者中得到验证。

 

基因组的商业终结

癌症通常被描述为基因组疾病,这意味着癌症是由 DNA 的变化引起的。基因组提供了制造蛋白质的指令,它是控制细胞生长的蛋白质,通常是精准药物的目标。

 

“蛋白质是基因组的业务端,在细胞中执行几乎所有关键功能,包括在癌细胞中,”研究人员之一,布罗德研究所蛋白质组学研究高级主任史蒂文卡尔博士说. 但是,还没有一种方法可以在可应用于临床环境的测试中全面测量蛋白质和影响其行为的化学变化。

 

许多类型的基因检测已经在临床中使用。例如,许多靶向治疗具有所谓的“伴随诊断”,被批准用于识别这些药物作用于肿瘤中的特定基因改变。美国食品和药物管理局已经批准了更全面的基因组分析,斯莱奇博士说,这些分析越来越多地用于分析转移性癌症。

 

“绝大多数药物都针对蛋白质。NCI癌症临床蛋白质组学研究办公室(OCCPR)主任 Henry Rodriguez 博士说:“直接分析您靶向的分子将是判断药物是否有效的最有效方法。 ” OCCPR 负责监督临床蛋白质组学肿瘤分析联盟,贝勒和博德团队是该联盟的成员。

 

开发“微型蛋白质基因组学管道”

到目前为止,蛋白质和遗传变化的联合分析,称为蛋白质基因组学,需要在手术过程中切除的“一角硬币大小的肿瘤块”,马修埃利斯博士解释说,医学博士,莱斯特和苏史密斯乳房中心主任在贝勒。

 

相比之下,核心针活检是在门诊环境中收集的,比手术更早在患者护理中进行,以帮助做出诊断并指导初始治疗过程。核心针活检包含的组织比手术中移除的组织少得多,因此 Broad 和 Baylor 的研究人员开发了从这些小得多的样本中获取类似信息的技术

 

博德研究所的 Shankha Satpathy 博士解释说,在对手术样本进行蛋白质基因组学分析时,通常会冷冻组织,然后将其粉碎成粉末,以便将均匀的材料用于 DNA、RNA 和蛋白质分析。研究小组。但是核心活检中没有足够的组织来采取这种方法。相反,为了分析均匀的样本,将针活检组织切成薄片,然后将其打乱以均匀混合切片。

 

为了能够从如此少的材料中提取尽可能多的信息,研究人员同时提取了 DNA 和蛋白质,然后以一种更容易在称为质谱仪的设备中检测和分类的方式标记蛋白质。研究人员报告说,他们还以一种允许在样本之间进行准确比较的方式组合蛋白质样本。

 

为了在临床实践中有用,蛋白质基因组学分析需要有效利用时间和组织。目前,基因组分析需要 2 到 3 周,Sledge 博士说。等待对患者来说可能是痛苦的,但“如果它提供更明确的信息和对治疗方案的更细致的观察,那么延迟是值得的,”他说。

 

Carr 博士说,他希望随着进一步的发展,这些蛋白质基因组学技术将在与单独的基因组学相似的时间范围内提供基因组和蛋白质组学结果。

 

概念证明:HER2 阳性乳腺癌

为了了解他们重新设计的蛋白质基因组学分析方法如何在现实世界中发挥作用,研究人员在接受曲妥珠单抗(赫赛汀)治疗的被诊断患有 HER2 阳性乳腺癌的女性的肿瘤样本上对其进行了测试,这是一种通过结合起作用的抗体HER2 蛋白并阻止它们发挥作用。

 

Ellis 博士解释说,至少五分之一的诊断为 HER2 阳性乳腺癌的患者对曲妥珠单抗没有充分反应。能够弄清楚这些患者是谁将非常有价值。曲妥珠单抗价格昂贵,并且会产生严重的副作用。此外,他补充说,给患者服用他们没有反应的药物会延迟可能更有帮助的治疗方法的使用。

 

研究人员在治疗前和开始曲妥珠单抗治疗后 48-72 小时再次分析了取自少数 HER2 阳性乳腺癌女性的核心针活检样本。研究人员发现,通过蛋白质基因组学分析,他们能够解释为什么一些患者对药物有反应,而另一些则没有。

 

在对治疗有反应的所有 9 名患者中,研究人员发现治疗开始后 HER2 蛋白活性水平低于治疗前。在没有反应的五名患者中,蛋白质基因组学提供了有关原因的重要线索。 “例如,在两种情况下,虽然肿瘤细胞具有 HER2 扩增,但它们的 HER2蛋白表达较低,这表明临床试验呈假阳性,”Satpathy 博士解释说。

 

另一名患者的肿瘤确实具有高水平的 HER2 表达,但它也过度表达了粘蛋白,这是一种覆盖细胞表面的蛋白质,可能会阻止曲妥珠单抗与癌细胞上的 HER2 结合。

 

对该患者肿瘤的进一步分析显示,一种名为mTOR的蛋白质活性升高。在对过度表达粘蛋白和 HER2 蛋白的乳腺癌细胞的实验室测试中,将曲妥珠单抗与靶向 mTOR 的药物依维莫司 (Afinitor) 联合使用,成功杀死了这些细胞。

 

“在靶向治疗的时代,了解治疗是正确的选择并且会有效至关重要,”埃利斯博士说。

 

“这些数据属于 HER2 阳性人群,但没有理由不能将这种蛋白质基因组学分析方法应用于其他人群,”斯莱奇博士说,例如患有三阴性乳腺癌和其他潜在癌症的女性。

 

 

TAGS标签: 肿瘤 , 基因
还有这些:
    SQL Error: select * from ***_ecms_ where classid=0 and (title like '%肿瘤蛋白质%' or title like '%基因%') order by newstime desc limit 3

相关文章

660*60广告
栏目ID=17的表不存在(操作类型=0)
栏目ID=17的表不存在(操作类型=0)

最火资讯

    栏目ID=2的表不存在(操作类型=0) 栏目ID=2的表不存在(操作类型=0)